اقتصاد اسلامی به عنوان برجسته‌ترین عرصه مورد نیاز در بنای جامعه و تمدن اسلامی، یکی از ساحت‌های اصلی مدنظر مؤسسان پژوهشکده مطالعات اسلامی در علوم انسانی بوده است. بر این اساس، گروه اقتصاد اسلامی با بهره‌گیری از ظرفیت علمی و پژوهشی حوزه و دانشگاه، تلاش نموده است گام‌های مؤثری در نظریه‌پردازی اقتصاد اسلامی و ارائه راهکارهای سیاستی مبتنی بر اقتصاد اسلامی به دستگاه و نهادهای اجرائی بردارد.
این گروه در حوزه های مختلفی همچون بانکداری اسلامی، اخلاق و اقتصاد، الگوی اسلامی ایرانی پیشرفت، اقتصاد مقاومتی و تعلیم و تربیت اقتصادی با ابزارهای در اختیار خود همچون تشکیل کارگروه‌ها، حمایت از رساله‌ها و پایان‌نامه‌ها، نشر کتاب و مقاله‌های علمی، برگزاری سمینارها و کنفرانس‌ها در سطح ملی، برگزاری کرسی‌های علمی ترویجی، کارگاه‌های آموزشی و تشکیل واحد فناور، محصولات علمی خود را عرضه می‌کند.